荧光标记方法实时荧光定量 PCR 荧光标记方法可分为荧光染料和荧光探针两类,染料类荧光定量 PCR 是利用与双链 DNA 小沟结合发光的理化特征指示扩增产物的增加;探针类荧光定量 PCR 是利用与靶序列特异杂交的探针来指示扩增产物的增加 。
荧光染料
染料法荧光定量 PCR 是利用荧光染料与双链 DNA 小沟结合发光的理化特征指示扩增产物的增加 。现以最常用的SYBR GreenⅠ为例,介绍染料法荧光定量 PCR 的工作原理:

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图 3:荧光染料法原理
SYBR GreenⅠ是一种荧光染料,可与双链 DNA 非特异性结合 。在游离状态下,SYBR Green Ⅰ发出微弱的荧光,但一旦与双链 DNA 结合,其荧光增加 1000 倍 。一个反应发出的全部荧光信号与出现的双链 DNA 量呈比例,且会随扩增产物的增加而增加,可通过荧光信号的增加来记录产物的增加 。
荧光探针
探针为一段寡核苷酸,可与 DNA 序列特异性结合,一个模板结合一个探针 。探针 5’端具有报告基团(R),可发荧光;3’端有荧光淬灭基团(Q),能吸收荧光 。探针完整时 R 基团所发射的荧光能量被 Q 基团吸收,PCR 仪检测不到荧光信号 。探针被酶水解后,R 与 Q 分开,PCR 仪可检测到荧光信号 。
Taq 酶有 5’→3’外切核酸酶活性可水解探针,在 PCR 延伸阶段探针被 Taq 酶酶切降解,报告基团(R)与淬灭基团(Q)分离,荧光监测系统可接收到荧光信号 。每扩增一条 DNA 分子,释放一个荧光信号,实现了荧光信号的累积与 PCR 产物形成完全同步 。

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图 4:探针原理
目前已经开发出来的探针有 Taq Man 探针、Taq man MGB 探针、双杂交探针、分子信标、Lux 杂交探针、Simple proble 探针等 。
探针法与染料法对比

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荧光定量 PCR 应用实时荧光 PCR 技术已广泛应用于临床及生命科学研究的各个领域中 。在科研方面可定量分析各种基因的表达分析,基因突变和多态性分析,单核苷酸多态 SNP 测定及易位基因的检测;在医疗方面可用于免疫组化分析、临床疾病早期诊断、病原体检测、耐药性分析、肿瘤微小残留病变研究等 。(转自先达基因 www.gendx.cn)
【pcr过程图 pcr过程图解第四轮】

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