呼吸抑制　当患者有某些呼吸系统或神经系统的疾病时，使用BZD可能造成呼吸抑制 。而BZD与酒精一起使用时，此作用也会跟着增强 。不过，一般不会有大碍 。过敏少数患者的体质特殊，还会对安眠药过敏，不管是哪一种药物，都有可能造成过敏现象 。性功能受影响　有报告显示，BZD在极少数情况下，会造成性功能障碍 。  
三环抗郁剂也可能引起阳痿、性欲减退等现象 。至于查诺顿（Trazodone），则可能延长男性勃起时间，但这都是可恢复的，不会造成器官损坏，或者永久性的障碍 。这跟酒精的作用不一样，长期服用酒精可能造成性功能永久性的障碍 。肠胃道不适　Zolpidem或佐匹克隆（Zopiclone），都有可能造成眩晕、恶心、呕吐与腹泻的副作用，但发生机率不高 。  
而三环抗郁剂也可能造成相似的问题 。只发生于辅助性安眠药的副作用 锥体外副作用与内分泌影响（罕见）  
部份三环抗郁剂跟抗精神病药会因为抗多巴胺的作用，导致锥体外副作用，会有急性肌肉失张、帕金森氏症状、静坐不能等副作用 。此外，也可能会造成泌乳素上升，女人可能因此月经中止，男人可能有乳汁产生，男女性欲下降 。但这类药物作为辅助睡眠之用时，几乎不可能发生这类问题 。  

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