在自然水域中，鱼屎会被微生物分解，而鱼缸中虽然也能借助它们分解鱼屎，但产生的氨氮会对鱼儿造成一定的毒害，所以需要硝化细菌将其转化掉 。一般在开缸的时候，需要定期加入硝化细菌，并且还要关灯爆氧，建立起硝化系统后，鱼屎被生物清理，也不会对鱼儿产生威胁了 。
一、过滤清理
鱼缸底部有鱼屎是很正常的，想要清理掉它们，最好的办法就是加强过滤 。过滤会在鱼缸中形成水流，水流会将这些污物带到过滤设备中，从而避免其污染水质 。如果鱼屎太大，可以加一个造浪机将其打碎 。
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二、换水清理
如果鱼缸中没有过滤，或者过滤的功率不够，想要清理鱼屎也是有办法的，那就是换水的时候清理掉 。准备一个管子，将其通到水底，用虹吸法将底部的水抽出，这样水底的鱼屎也会跟着一同排出，之后再缸里添新水 。
三、生物清理
在自然水域中，鱼屎会被微生物分解，而鱼缸中虽然也能借助它们分解鱼屎，但产生的氨氮会对鱼儿造成一定的毒害，所以需要硝化细菌将其转化掉 。一般在开缸的时候，需要定期加入硝化细菌，并且还要关灯爆氧，建立起硝化系统后，鱼屎被生物清理，也不会对鱼儿产生威胁了 。
四、减少投喂
前三种方法都是清理鱼屎，其实想要避免鱼缸中有太多鱼屎，最好的办法还是从源头入手，减少给鱼儿的投喂量，这样鱼屎自然也就少了 。每次喂鱼可以喂到七八分饱，另外还要避免鱼缸中有残饵 。
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