碘伏应在酸性或中性环境中使用，因为其在碱性环境中杀菌作用减弱 。有机物（例如油脂、蛋白质等）也可降低其疗效，须避免接触 。
注意消毒时间
碘伏的浓度为O.5%，用于注射部位消毒需半分钟以上，用于皮肤创伤消毒需保留2分钟以上，用于口腔、妇科等黏膜消毒需用纯净水稀释l0倍 。
对金属有腐蚀性
碘伏对金属有腐蚀性，所以不可用于金属容器的消毒和浸泡物品 。碘伏应在阴凉、避光、防潮的地方密封保存；碘伏对铜、铝、钢等二价金属有一定的腐蚀性，不能用于这些金属制品的消毒；碘伏对于有机物（比如油、皂脂类等）有一定的对抗性，如果您遇到对这类物品的消毒，应该增加药物浓度，或是延长时间，以保证消毒效果 。
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