通常情况下这两种疾病医务人员是不会拿到一起来进行鉴别诊断的 。虽然这两种疾病都是感冒（上呼吸道感染）的特殊形式，但是从临床症状上来，疱疹性咽峡炎与手足口病的症状更加相似，所以常规情况下是把疱疹性咽峡炎和手足口病进行鉴别；而流感则是和普通感冒相鉴别 。
疱疹性咽峡炎的病原体为柯萨奇病毒，好发于夏秋时节，起病急 。临床表现为高热、咽痛、流涎、厌食、呕吐等症状 。体格检查可发现咽部充血，在咽腭弓、软腭、腭垂的黏膜上可以出现2~4mm大小的灰白色疱疹，周围有红晕，1~2天后破溃形成小溃疡 。病程在一周左右 。由于手足口的致病病毒中也有柯萨奇病毒，因此，两者在临床表现上非常相似，误诊率极高 。但是治疗方案都是相同的 。家长们不需要过度紧张 。流行性感冒则是由流感病毒引发，冬春季流行，主要的临床表现为高热、头痛、干咳、四肢肌肉酸痛、全身乏力、少部分人出现恶心、呕吐、腹痛的情况，在婴幼儿，流感病毒极易合并肺部感染 。传染性较强 。不会出现口腔疱疹的情况，仅通过这一个临床表现即可区别两者 。希望回答对您有所帮助 。

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病毒通过消化道、呼吸道侵害你的咽喉、扁桃体产生喉里面有粘液，扁桃体周围以及口腔有有红点体温36度7致36度8，打吊瓶越打越严重，吃抗生素药也是加重，生凉辛棘油，白天服药、晚上微烧，一不吃药就烧，见议服退烧药、不要服抗生素，加吱咳糖浆，一天三次、多喝开水坚持一个周试试？这是本人的经历，有病到医院检查，不要采取我的方式 。人与人不一样 。
疱疹性咽峡炎是由肠道病毒引起的，而流感主要由有流感病毒引起的，但两者都具有传染性，相同的临床表现有：高热、咽痛、头痛、四肢疼痛等症状 。
区别在于，疱疹性咽峡炎典型的症状出现在咽部，常表现为咽部充血，起病2日内口腔黏膜出现数个小的灰白色疱疹，周围绕以红晕，2-3天后红晕会加剧扩大，疱疹破溃形成黄色溃疡；而流感通常会有普通感冒的症状，如咳嗽，流鼻涕，打喷嚏等 。
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流行性感冒则是由流感病毒引发，冬春季流行，主要的临床表现为高热、头痛、干咳、四肢肌肉酸痛、全身乏力、少部分人出现恶心、呕吐、腹痛的情况，在婴幼儿，流感病毒极易合并肺部感染 。传染性较强 。不会出现口腔疱疹的情况，仅通过这一个临床表现即可区别两者 。
预防流感的方法大家多少都知道，加强身体锻炼，注意个人卫生，不扎堆，发现症状及时就医，这里就不多说了 。
听过我的课《话说“”妖魔”流感的预防》的爸爸妈妈们，以及看过我关于流感的父母，更想知道的一定是关于疱疹性咽颊炎 。首先，我想说这是一种过程虽然痛苦，但却是可自愈的小儿疾病，家长们首先要以冷静和淡定的态度来面对它 。
疱疹性咽峡炎高发季节，我们需警惕，切忌把一切发烧当感冒，疱疹性咽峡炎我们需了解一下四点：
一、疱疹性咽峡炎非细菌感染
肠道病毒是引起疱疹性咽峡炎的主要病原体，主要为柯萨奇病毒 。疱疹性咽峡炎潜伏期为2～4d，该病不同感冒引起的细菌感染，使用抗生素无效 。
也就是说疱疹性咽峡炎，以及总是会被一同提起的手足口病，都是由肠道病毒感染引起的，以柯萨奇病毒和EV71为主 。也就是说，手足口病和疱疹性咽峡炎是同一种病毒感染引起的不同临床表现 。
疱疹性咽颊炎是一种特殊类型的上呼吸道感染，婴幼儿尤其是3岁以下的孩子很容易被感染，潜伏期一般为4到7天 。

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