根据《旧唐书》记载，秦琼作为李世民的铁杆嫡系和心腹，肯定参加了玄武门之变，并发挥了一定作用，只是他的表现不够突出，作用也不明显 。玄武门之变后，秦琼出任左武卫大将军，实封700户，可以侧面佐证 。
或许有人会质疑，玄武门之变后，同样是参与其中武将，为何秦琼的待遇比尉迟恭、长孙顺德、张公瑾、侯君集、刘师立等要低很多？其实这跟他在玄武门之变中扮演的角色和表现有很大关系 。
角色
从事后的封赏来看，出谋划策的谋臣相对比执行层面的武将高，秦琼虽然积极参加了玄武门之变，但他属于具体执行层面的（上战场杀人），没有参与具体谋划，在玄武门之变的战场上也没有出彩的表现，充只能算是正常发挥，充当的是防御或者增援作用，因此实封相对不高 。我们列举排在秦琼前面的参加玄武门之变的武将就可以看出来 。
尉迟敬德，1300户；
长孙顺德，1200户；
侯君集、张公谨、刘师立，各1000户；
秦叔宝（秦琼）、程知节（程咬金），各700户 。
尉迟敬德：诛杀李元吉，救救李世民，击退李建成余党，并出面逼李渊退位；
长孙顺德：长孙皇后的族叔，危急时刻增援玄武门，击退李建成余党；
张公瑾：危机时刻，以一己之力及时关闭玄武门，暂时挡住李建成余党的进攻，为增援部队赢得时间 。
侯君集：参与具体谋划
刘师立：参与具体谋划
综上所述，秦琼跟他们相比，没有突出的表现，自然实封比他们低 。
表现
【唐朝开国将领秦叔宝是”玄武门之变“功臣之一吗？】秦琼在玄武门之变的战场表现跟他在战场上的位置有很大关系 。据史料记载，玄武门之变时，秦琼没有出现在决定胜负的关键战场上，这也就造成他很难有突出的表现 。为什么秦琼没有被按排在重要位置？玄武门之变是李世民一生中最凶险的一战，事先必定做好了万全准备和通盘考虑 。其一、秦琼以勇猛著称，常年冲锋陷，当时身体很不好，经常生病，他曾对人说：“我戎马一生，历经大小战斗二百余阵，屡受重伤，前前后后流的血能都有几斛之多，怎么会不生病呢！”，所以不大可能把他按排在重要的厮杀战场位置；其二、当时主战场主要在临湖殿和玄武门，其他位置主要负责防御和增援，因此同样需要得力的将领坐镇，比如秦王府，李世民的家眷都在那里 。所以，李世民在刚开始的时候并没有把秦琼安排在最关键的战场，一是基于保护秦琼的考虑，二是其他位置也要按排得力大将镇守 。

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