治疗胃肠道功能紊乱主要是对症治疗，要遵循综合治疗和个体化治疗的原则，要教育患者建立良好的生活习惯和饮食习惯，避免烟、酒及服用非甾体抗炎药，需要避免进食个人生活经历中会诱发症状的食物 。
【如何治疗胃肠道功能紊乱】上腹痛的患者可以选择H2受体阻滞剂或PPI类药物 。如果有上腹胀，早饱 ， 嗳气等，可以选择多潘立酮，莫沙必利，伊托必利等 ， 还可以联合使用助消化药，如复方消化酶，复合维生素B等 。腹泻的患者可以选择蒙脱石散，药用碳 ， 洛哌丁胺，地芬诺酯等药物止泻治疗 。如果有便秘的患者可以选择乳果糖，硫酸镁，甘露醇 ， 蓖麻油，酚酞等 。肠道微生态制剂，如复方嗜酸乳杆菌 ， 双歧杆菌，酪酸菌等，对于腹痛，腹胀的患者有缓解的作用 。如果症状严重，上述治疗无效，可以选择抗抑郁药物进行治疗 。
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