1、成分不同，玉石分为软玉和硬玉，软玉主要成分为钙镁硅酸盐，硬玉为硅酸铝钠，而玛瑙是二氧化硅；2、范围不同，玉石种类繁多，玛瑙是玉的一种；3、颜色不同，玛瑙品种繁多、色彩鲜艳，颜色没有玉纯粹；4，纹理不同，玛瑙带有花纹，玉石一般没有 。
1、成分不同
玉是矿物集合体，成分不一，玉石分为软玉和硬玉，软玉以和田玉为代表，主要成文为钙镁硅酸盐;硬玉以翡翠为代表，其主要成分是硅酸铝钠 。而玛瑙的主要成分是二氧化硅，是石英的一种隐晶质变体 。

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2、范围不同
玛瑙是玉石的一种，广义上来说，形状美观、坚硬特点的矿物质统称为“玉”，玉石主要包括翡翠、蓝田玉、羊脂玉、猫眼石、玛瑙、琥珀、珊瑚等 。玛瑙属于玉髓类矿物的一种，混合了蛋白石的带有纹理的块体 。
3、颜色不同
玉石一般分为硬玉、软玉，根据分类玉石种类不同，颜色也不同 。其中硬玉主要是翡翠，呈翠绿色；汉白玉主要是纯白色的大理石岩;阳起石又呈深绿色、黑色、白灰色 。而玛瑙品种繁多，色彩鲜艳，一般颜色有红、蓝、紫、白、灰、褐等 。
4、纹理不同
因为玉石和玛瑙的结构不同，导致玉石和玛瑙在外表上也有不同 。通常情况下，因为玛瑙断口具有锋利边缘的贝壳状，所以几乎所有的玛瑙都带有条纹，透过自然光照或者手电筒就能看见 。而玉石是含水的钙镁硅酸盐，因此在自然光照和手电筒的照射下几乎没有纹理 。

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