侵犯商业秘密行为由县级以上工商行政管理机关认定处理，依照《反不正当竞争法》规定，责令停止违法行为，处以1万元以上20万元以下的罚款;同时，工商行政管理机关有权处理侵权物品，责令并监督侵权人将载有商业秘密的图纸、软件及其他有关资料返还权利人;监督侵权人销毁使用权利人商业秘密生产的、流入市场将会造成商业秘密公开的产品 。但权利人同意收购、销售等其他处理方式的除外 。
【法律依据】
【工商行政管理机关怎样查处侵犯商业秘密行为】根据《反不正当竞争法》第二十一条，经营者以及其他自然人、法人和非法人组织违反本法第九条规定侵犯商业秘密的，由监督检查部门责令停止违法行为，没收违法所得，处十万元以上一百万元以下的罚款;情节严重的，处五十万元以上五百万元以下的罚款 。

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