公司破产股东资产清算的程序是：
1、调查和清理公司财产 。清算组在催告债权人申报债权的同时，应当调查和清理公司的财产 。根据债权人的申请和调查清理的情况编制公司资产负债表、财产清单和债权、债务目录 。应当指出的是，清算组在编制资产负债表时，不得将公司财产价值低估 。
2、制订清算方案 。编制公司财务会计报告之后，清算组应当制订清算方案，提出收取债权和清偿债务的具体安排 。

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3、提交股东会通过或者报主管机关确认 。清算方案是公司清算的总方案 。因此，股份有限公司的清算组应将清算方案提交股东大会通过 。但是，有限责任公司的清算组成员是由股东组成的，所以，无须提交股东会另行通过 。将清算方案提交有关主管机关确认的规定，适用于因违法而解散的清算公司 。
4、另外，如果公司清算组在清理公司财产、编制资产负债表和财产清单时，发现公司财产不足清偿债务的，清算组有责任立即向有管辖权的人民法院申请宣告破产 。经人民法院裁定宣告破产后，清算组应当将清算事务移交人民法院 。

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