《自然·通讯》杂志称美污水检测出神秘新冠病毒

《自然·通讯》杂志称美污水检测出神秘新冠病毒
文章图片

加州大学伯克利分校研究人员开发了一种从下水道系统中收集未经处理的污水并测试其是否存在新冠病毒的方法 。 图为该校员工从下水道中取出废水自动进样器 。 图片来源:艾琳易/加州大学伯克利分校
据《自然·通讯》杂志近日报道 , 研究人员在美国纽约下水道的污水中检测到了新冠病毒的“神秘谱系”——具有新突变模式的病毒片段 。
报道称 , 研究人员2021年1月已在纽约市发现了这种病毒 , 过去的一年中 , 它“持续出现在纽约市的污水中” 。 自2020年年中以来 , 美国加州大学伯克利分校的研究人员在旧金山湾区(可能还有加州更远的地方)多个下水道的废水中也持续发现了类似的“神秘谱系” 。 美国其他城市也有类似的发现 , 但尚未公布 。 这引发了人们对新冠病毒是否正在逃避免疫的新担忧 。
目前尚未有证据表明该病毒已经传播了多久 , 但研究指出 , 该谱系中的许多病毒与新冠病毒变异株奥密克戎存在大量共享突变 。
奇怪的是 , 这种病毒只存在于人类的排泄物中 , 而非人体内 。 美国加州大学伯克利分校的科学家表示 , 它没有显示出引发疾病的迹象 , 也没有导致新的疫情暴发 。
研究人员自己也对这些谱系的起源意见不一 。 一些人倾向于认为病毒来自那些感染病毒的人 , 他们的感染没有被测序捕捉到;还有人怀疑 , 这一“谱系”的病毒可能来自感染新冠的动物 , 可能是这座城市庞大的老鼠种群 。
病毒源头仍然未知 但“土生土长”在美国
据《纽约时报》报道 , 自2020年6月以来 , 研究人员一直在对纽约市14家污水处理厂的废水进行采样 。 2021年1月 , 他们开始对样本进行有针对性的测序 , 重点放在病毒最重要的刺突蛋白的部分基因上 。
美国生命科学网报道称 , 研究人员检查了来自世界各地的5000个其他废水样本 , 只在7个样本中发现了这一“谱系” , 都来自纽约州 。 不管这种病毒是什么 , 它们都是“土生土长”在美国的 。
科学家们还没弄清楚这些病毒的“谱系”来自哪里 。 他们认为 , 这些“神秘谱系”的病毒可能来自那些未能检测出来或尚未检测的感染者 。 但研究人员表示 , 考虑到纽约人以及可能携带某种变种的人往往不受限制地在全市流动 , 病毒不断出现在同一些污水处理厂的事实 , 这种理论不太可能 。
研究人员发现 , 具有新突变模式的病毒片段在少数几家处理厂反复出现 。 他们表示不能透露具体的工厂或地区 。
到目前为止 , 还没有在纽约的临床患者中发现这些变异 。 尽管如此 , 论文作者之一、英国剑桥大学皇后学院病毒学家约翰·丹内伊博士推测 , 这些病毒可能来自那些被限制在该市少数地区医疗机构的人 。 但他一直无法证明这一点 。
丹内伊表示 , 我们能够把它的源头锁定在某些医院的排污棚的一小块区域内 。 他给这些地区的医生和医院发了电子邮件 , 但从未收到过回复 。
神秘病毒与奥密克戎存在相同突变
研究人员使用了一种病毒基因组测序技术 , 但这种测序只集中在病毒进入细胞所需的大约一半的刺突蛋白上 , 包含受体结合域(RBD) 。 许多允许奥密克戎逃避疫苗抗体或非奥密克戎感染的突变都存在于RBD 。 在纽约市废水中发现的“谱系”中的病毒突变也是如此 。 研究人员使用“谱系”一词是为了避免与世界卫生组织使用的“值得关切的变异株”一词混淆 。
有趣的是 , 这种神秘病毒有一些与奥密克戎相同的突变 , 或者在相同的位置发生突变 。 实验表明 , 这些病毒也可能逃避某些抗体 。

特别声明:本站内容均来自网友提供或互联网,仅供参考,请勿用于商业和其他非法用途。如果侵犯了您的权益请与我们联系,我们将在24小时内删除。