对于左宗棠，肃顺对他更是有再造之恩 。当时左宗棠为湖南巡抚骆秉章幕僚，因恃才傲物，与永州镇总兵樊燮产生了不可调和的矛盾，樊燮则通过湖广总督官文恶人先告状，说左宗棠以下犯上，居心叵测 。咸丰皇帝接到奏折后大怒，下旨严查：“如左宗棠有不法情事，可即就地正法 。”
肃顺深知左宗棠之才，在咸丰皇帝面前极力保护左宗棠，盛赞左宗棠人才难得，自当爱惜 。恳请咸丰皇帝：“请再密寄官文，录中外保荐其疏，令其察酌情形办理 。”
湖广总督官文见皇帝要他“酌情办理”，立马就明白皇帝的意思，便没有为难左宗棠，左宗棠算是逃过一劫 。假如没有肃顺的保护，左宗棠恐怕脑袋就搬家了，也就没有后来收复新疆的壮举了 。因此，新疆能够回到祖国的怀抱，肃顺也有一分功劳 。
乱世用重典，也是肃顺的治国理念 。从咸丰八年到咸丰九年之间，肃顺分别办理了“戊午科场案”和“户部宝钞案”两个大案 。
在“戊午科场案”中，主考官是柏葰 。他官居文渊阁大学士，是内阁一品大员 。这次失察之罪，本不当死 。咸丰皇帝也有意网开一面 。但肃顺认为乱世应用重典，非杀柏葰不足以改变科场舞弊的不良风气 。最终在肃顺的坚持下，咸丰下旨判柏葰斩首 。《清史稿》是这样评价斩杀柏葰的影响：“自此司文衡者懔懔畏法，科场清肃，历三十年，至光绪中始渐弛，弊窦复滋，终未至如前此之甚者，实文宗用重典之效，足以挽回风气也 。”
1861年8月22日，咸丰帝病逝于热河行宫 。临终前，咸丰皇帝认命肃顺等八人为顾命大臣，让他们辅佐同治皇帝 。但咸丰皇帝却没有给他们实际的权力，这八个人身份是“赞襄”，是顾问的意思 。也就是说这八个人有顾命之名，而顾命之实 。就这样，咸丰皇帝对这八个人还不放心，又让两宫太后参与权利分配 。他分别给慈安慈禧各一枚印章，八大臣做出任何决策，必须经两宫太后同意，盖上印章，方可实行 。在咸丰皇帝看来，他的临终遗嘱，即消减八大臣权力，又避免了女人干政，不可为不完美 。
可咸丰皇帝做梦都没想到：他这样做，让野心勃勃的慈禧权力欲急剧膨胀起来 。咸丰皇帝刚一死，慈禧就与八大臣因为权力之争，发生激烈的冲突 。慈禧自感凭借两宫的力量，斗不过八大臣 。于是，就暗中联络远在京城的恭亲王奕訢，准备联手扳倒八大臣 。此时，恭亲王掌管着京城的军政大权，而他又和肃顺有很深积怨，他要想出人头地，也只有扳倒八大臣这一条路可走 。
于是，奕訢在京城磨刀霍霍，只等着八大臣与新皇帝回京 。肃顺这时大意了，自认为有顾命大臣的护身符，谁也不敢奈何他！殊不知，一场血腥杀戮正在悄无声息向他逼近 。肃顺等八人刚回京，奕訢就发动兵变，逮捕他们，将这八大臣杀的杀，逼死的逼死 。于是，同治年间就出现了，两宫垂帘，奕訢辅政的局面 。
假如没有辛酉之变，慈禧不可能专权几十年，肃顺也不会被杀 。以肃顺眼光与胸襟，肯定不会因循守旧，会和世界接轨，很可能就没有后来的割地赔款和甲午战争之耻了 。
肃顺，满清王朝最后一位有可能将满清这艘巨舰扳回正常航道，并有可能让满清中兴的满族权臣，原本不但无罪还有功，但是因为阻挡了慈禧太后夺权的路，被慈禧太后后和恭亲王奕訢发动“辛酉政变”赶下台，斩立决处死于市井 。
肃顺在咸丰年间是一代重臣，其兴汉抑满、整顿朝政、对外强硬，让咸丰朝有了回光返照的生机 。也自嘉庆后期的第一次鸦片战争后，清朝没有被列强勒索成功过一次 。实在堪称外交奇迹，特别是在与沙俄谈判时，沙俄拿出《瑷珲条约》，被肃顺扔在一边，完全无视，霸气之极 。

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