宝可梦是宝可梦世界之中，和人类一起生活的生物 。许多人类尊重并善待宝可梦，也有一些人类试图滥用它们 。宝可梦具有感情，并在某种程度上能理解人类的语言 。生态环境的变化也受宝可梦的影响 。和现实世界的生物相比，许多宝可梦拥有超出现实世界生物的能力 。
进化
在神奥传说中，宝可梦和人类最初并不分彼此，属于同一个种群 。随着时间的推移，一部分生物演变成了人类 。这种说法在宝可梦世界中提到很多次，但并未得到证实 。梦幻被认为是宝可梦的祖先，它演化成为其它宝可梦 。最早的人类诞生于数百万年前的石器时代 。在生物学和遗传学上，所有的宝可梦都同属一种物种的不同分支，所以即使是不同种的宝可梦也有可能在培育屋中生蛋 。
在现代的宝可梦世界，进化一词专指宝可梦在生长到一定阶段、或在特定条件下转变为另一种宝可梦的过程 。进化并不只是体型变大，一般进化形态的宝可梦拥有更强大的种族值，学会不同的招式，甚至改变属性 。许多宝可梦都可以进化 。
宝可梦的进化，更类似于现实世界的生物变态而非进化，和进化一词相似的其中一个案例是结草儿，它会根据环境来改变进化后的形态 。
繁殖
几乎所有宝可梦都可以进行繁殖，没有性别的宝可梦也可以和百变怪生蛋 。只有幼年宝可梦及未发现蛋群的宝可梦还有百变怪无法生蛋 。除了玛纳霏和霏欧纳之外，所有传说的宝可梦都是未发现蛋群 。和现实世界的生物一样，许多宝可梦有性别之分，有些宝可梦可以通过性别差异来分辨 。通常，训练家的宝可梦一般在培育屋中生蛋 。宝可梦繁殖的方式并不为人所知，也不为人所见 。
宝可梦在出生之前生活在蛋里，宝可梦的蛋有坚硬的外壳保护着它的成长 。蛋的外形通常会有所属的宝可梦的花纹 。和现实世界的动物一样，宝可梦会竭力保护它们的蛋，把蛋守护在离它们很近的地方 。在成长到一定程度后，宝可梦就会从蛋中孵化出来 。宝可梦孵化所需要的时间依宝可梦的种类而有所不同，但若把蛋存放在电脑里，蛋的成长就会暂停 。
有些宝可梦有幼年形态 。幼年形态的宝可梦在进化之后，才可以进行繁殖 。许多存在幼年形态的宝可梦的蛋只会孵化成为幼年形态；然而有些宝可梦的蛋一般会孵化成略成熟一些的形态，只有在生蛋时携带对应的薰香，才会使蛋孵化成幼年形态 。
生命历程
宝可梦也有生老病死的过程 。主系列动画中长期回避宝可梦的死亡问题 。在火斑喵，启程之时！中第一次出现关于长毛狗死亡的暗示，但依然没有正面描写；在小陨星与毒贝比，消逝在星空的约定！中，展示了小陨星的分解过程，这是动画第一次直接展示宝可梦的死亡过程 。在后来的身处卡璞?鳍鳍的迷雾中中，明确显示了长毛狗的死亡，另外在小智，穿越时空的邂逅！中，也暗示了霸主朽木妖的死亡 。在电影版中，则多次正面提到宝可梦的非正常死亡，如水都的守护神 拉帝亚斯与拉帝欧斯中的拉帝欧斯、梦幻与波导的勇者 路卡利欧中的路卡利欧、破坏之茧与蒂安希中被伊裴尔塔尔吸收生命的宝可梦等 。
宝可梦作为食物
在宝可梦图鉴中，曾多次提到一些宝可梦会以其它种类的宝可梦为食，比如大比鸟会从水中捕捉鲤鱼王 。一些地区也提到人类会食用宝可梦，比如主角妈妈的红莲火山汉堡，火箭队兜售的美味尾巴 。大葱鸭也因为被过度捕食而数量锐减 。一些神奥传说中也提到了食用宝可梦，其中称如果把它们的骨头捡干净放在清澈的水里，宝可梦就会获得重生 。

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