有关日本的内容主要是限定日本战后的国家主权(本州)；说服苏联尽快宣布对日本开战；原本规定以“德国模式”派遣军队占领日本，但为了避免日本的分裂，最后改为美国独自出兵 。
最大的争议，或者说“有条件投降”集中泽对于日本天皇制度的废立；日本人当然希望保留天皇，作为国家的象征；美国占领军将领也认为保留天皇是避免美军占领日本后无谓的牺牲 。
除此之外，还有就是日本的“自卫队” 。日本战败，皇军(国防军)彻底解散；但是，日本方面是否需要保留“自卫”的能力；这也是波茨坦会议的议题之一 。
日本投降后，苏联的兴趣不在欧洲，对日本无暇顾及；英国换了一届政府，对外政策也有相应的改变；当时的国民政府忙于内战；
所以只有美国人留在日本掌控着日本战后的政治经济走势；如前所述，美国人为了方便自己在日本的统治，保留了天皇以及“靖国神社”，对于战犯的处理也是迁就姑息；
【日本是不是无条件投降的？日本有没有拒绝波茨坦公告？】因此，日本的投降不是“无条件”而是“有条件”的利益互换 。

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