重新整理的这部分汉简，红外和彩色图版同时呈现，随图附有释文，且释文进行了重新校核 。如1298号简原释文为：
马以节属吏用传及将兵吏边言缘人惊……
□武皇帝一元鼎六年九月辛巳下凡六百
所令
本书的释文为：
马以节若使用传信及将兵吏边言?以惊闻献廿实驾者四得□兵以□负其以厩令使□
孝武皇帝元鼎六年九月辛巳下凡六百一十一字
厩令
原释三十四字，今释五十五字，不仅多释出二十一个字，而且将“所令”改释为“厩令”，其意义不仅仅在于一个字的正误，还在于为研究者提供了新的视野 。而“所令”一词则不知所云 。
又如，1301号简原释文为：
【八月辛巳日 农历8月二十四辛巳日风水总纲】神爵二年十一月癸卯朔乙立悬泉啬夫□□敢言之爰书厩御千乘里畸利课告曰所葆养传马一匹雕牡□□□□□□□二□为六尺一寸□□□□送□匹五乘至莫安病死即与
御张乃始=治定药期马死□定毋病□□索□病死审澄之它如爰书敢言之
此简的释文，此前已有胡平生《匈奴日逐王归汉新资料》（《文物》一九九二年第四期）、何双全《敦煌新出简牍辑录》（《简帛研究》第一辑，法律出版社，一九九三年）、吴礽骧《中国简牍集成》第四辑（敦煌文艺出版社，二〇〇一年）等加以大幅改释和补释 。本书在此基础上释作：
神爵二年十一月癸卯朔乙丑悬泉厩佐广德敢言之爰书厩御千乘里畸利辩告曰所葆养传马一匹骓牡左剽久生腹齿十二岁高六尺一寸□□敦煌送日逐王东至冥安病死即与
御张乃始∠泠定杂诊马死身完毋兵刃木索迹病死审证之它如爰书敢言之
显而易见，原释和今释，不仅在于释读的正误、认读的字数多少、全句的贯通理解等，更重要的还在于后者引出一件“日逐王归汉”的重大历史事件，价值和意义就不可低估 。诸如此类，所在多有，相信读者会自见高下 。因此本书第四部分，亦属重新整理之新成果 。
书中第一部分玉门关汉简的释文全部由张德芳释读完成，第二、三、四部分释文在原来零散释文的基础上，亦由张德芳重新修订补充 。附录一《相关简号对照表及尺寸规格》由张德芳根据一些零星材料编制而成 。总之，面对这样一些出自不同时间、不同地点、不同出土方式的零散材料，从拍摄扫描到简文释读，从有序编排到规格尺寸，从每一个地点的踏查到每一个简号的核对，整理者都付出了无数个日日夜夜的艰辛劳动 。
二〇一九年九月十三日至十六日中秋佳节之际，甘肃简牍博物馆、敦煌市博物馆、陕西师范大学人文社会科学高等研究院等文博单位和大专院校邀请国内古文字学、简牍学、历史学界的专家学者相聚于汉简出土地的敦煌，召开“《玉门关汉简》整理校稿暨审稿定稿会议”，对玉门关汉简的释文逐条逐字进行了校读审订，实际上仍为整理再整理的后续阶段 。参加这一工作的专家学者分别是：清华大学出土文献研究与保护中心黄德宽教授、李均明教授、侯旭东教授、刘国忠教授、郭伟涛助理教授；中国人民大学国学院王子今教授；南开大学历史文化学院杨振红教授；中国历史研究院简帛研究中心邬文玲研究员；中国文化遗产研究院胡平生研究员、刘少刚研究员、杨小亮副研究员；陕西师范大学人文社会科学高等研究院沙武田教授、李胜振副教授；西北师范大学科学研究院韩高年教授，历史文化学院李迎春副教授；兰州城市学院马智全副教授；甘肃简牍博物馆张德芳研究员、杨眉副研究员、樊钧特聘研究员；敦煌市博物馆原馆长傅立诚、现任馆长石明秀；敦煌阳关博物馆馆长纪永元；中西书局秦志华社长及田颖、徐衍两位责任编辑等 。会议时间虽短，但每位参会专家认真校读，各抒己见，提供了很多有价值高水准的修改意见 。会后由马智全、李迎春综合整理，吸纳校改 。

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