这件事情梳理一下，应该有三个单位，总的来说都是一条产业链上的不同环节：
比如，甲企业，是棉纺厂，负责生产棉纱，这是生产加工的第一个环节
比如，乙企业，是面料厂，负责生产面料，这是生产加工的第二个环节，
比如，丙企业，是服装厂，师傅生产服装，出口销售，这是生产的第三个环节，
这条产业链的终端，就是国外的广大消费者了 。
现在的问题出在哪儿呢，你自己本身的采购和销售都没有问题，但是你的上游客户的采购环节出现了虚假的增值税专用发票 。从而影响你们退税了 。
其实在前几年，我们的下游客户出口，我们也曾经接到天津税务局发出的协查通知，他们也是要出口退税的，要核查业务的真实性，结果就查到当时的公司了 。第一年很容易，第二年就遇到一些问题，实际上面料的生产从棉纱到布，再到印染环节，工序还是挺多了，都是采用委托加工的方式，要做到每个环节都有据可查还是挺麻烦的，单据的传输就存在一定的困难 。
遇到这种问题怎么办呢？首先肯定要把自己摘出来，证明自己的业务真实有效，并不存在虚开发票的问题，只要能证明这一点，问题就不大，至于不能退税，只能怪自己不小心选择了一个猪队友，对方出事，牵连自己 。
所以，我认为如果身份是一般纳税人的公司在选择合作伙伴时，一定要选择商誉好值得信赖的伙伴，不是自己的真实业务，即使发票是真的，也不能接受虚开的发票，因为增值税专用发票一定是涉及双方的，在这件事情上，肯定是一个愿打一个愿挨，如果没有授意，对方肯定不能随便开具发票 。
如果你经营的是一般纳税人公司，要找一个专业的财务，在这件事情上不能小气，否则监管这么严，不一定什么时候就车仰马翻 。

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企业因为供应商的问题，下游企业收到了异常凭证，那么可能无辜躺枪 。所以，对于下游企业来说，最重要的是要做好供应商的筛选，排除掉相关的风险 。
按照本题的情况，有可能是收到了虚开发票，这时候对于企业来说，也应该尽最大的可能降低税收上的损失 。
这时候，如果企业是善意取得，并能够重新从销售方取得合法、有效的发票并且还有税务机关证明，那么或许能够重新抵扣或者退税 。
如果要证明自己是善意取得，有四个条件：
一是购货方与销售方存在真实的交易，
二是销售方使用的是其所在省(自治区、直辖市和计划单列市)的专用发票，
三是专用发票注明的销售方名称、印章、货物数量、金额及税额等全部内容与实际相符，
四是且没有证据表明购货方知道销售方提供的专用发票是以非法手段获得 。
其中，第四条需要看看是否有相关的证据 。
这时候，企业需要尝试最大限度的补救措施，包括：
1.清理进行交易时签订的购销合同，是否存在真实的购销关系；
2.找齐货物入库出库的记录；
3.账务上增值税专用发票金额与货款、实际货物进行比对，检查是否票、货、款相符；
4.积极证明接受增值税专用发票时不知道其属于虚开的增值税专用发票 。
所以，对于企业来说，一是防范于未然，做好供应商的调查和筛选，二是为了以防万一，要保留好所有的交易证据，保证业务真实；三是如果防不胜防，事情发生了，尽量想办法补救 。
一般来说，题主遇到的这种情况是不多见的，但现在不幸已经遇到了，该怎么办?
首先，只要采购纺织品业务是真实的，经得起税务机关调查，就不必担心出口退税退不回来的问题，只是退税时间问题 。

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