1.针不对症
脑炎根据病原体的不同可分为:病毒性脑炎，结核性脑炎，细菌性脑炎，隐球性脑炎，无菌性脑炎 。
一般接种只预防流行性脑炎，对其它种类的脑炎并不能起到预防作用
2.接种不当导致接种失败，不能起到作用
【为什么有些打过预防针的小朋友还会得脑炎？】3.感染与接种间隔时间太短，导致在体内还没有产生足够抗体时就遭受病原体感染 。

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脑炎是指脑实质受病原体侵蚀导致的炎症性病变 。侠义脑炎指脑实质受病原微生物直接侵犯所引起的炎性改变 。绝大多数病因是病毒，也可由细菌、霉菌、螺旋体等感染而起，有的可能是变态反应性疾病，多指病毒性脑炎和急性播散脑脊髓炎的感染后脑脊髓炎 。按病程分为急性、亚急性、慢性，按病原微生物分为流行性与散发性 。脑炎可以发病于不同性别和年龄，临床上多以高热、头痛、呕吐、昏迷等症状为其特征，多以儿童发病为主 。
目前儿童打的疫苗只有流脑和乙脑，不是预防所有的脑炎，只是针对常见的脑炎进行预防 。
接种疫苗只是减少了得这种脑炎的概率，接种后有百分之二十可能得这种脑炎的概率降低到百分之二，所以小孩即使接种了疫苗，还会发生得脑炎的情况，这就说明疫苗研制还有很多的空白区 。

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