谢邀 。这个设问的限定条件略显欠缺 。若为同一人 ， 高考进清华读本科 ， 与之后再考研进清华没有区别 。
若为不同的学生 ， 还是有区别的 。一般来讲 ， 对于受过中、高等教育（或文化水平相当）的人 ， 无论是学生、家长、用人单位还是社会人士 ， 都多少带有一种“第一学历”和“本科身份”的情怀 ， 尤其带有一种“清北情结” ， 这种情结 ， 既具有一定的主观性 ， 也具有一定的客观性 。比如 ， 有甲乙两名学生 ， 甲通过高考进入清华 ， 乙通过高考进入某普通高校 ， 之后通过考研进入清华 。从表面看 ， 甲和乙都有着令人羡慕的清华经历 ， 但在某些人眼中 ， 甲和乙是有差别的 ， 即：甲的学习能力（或应考能力）要强于乙 ， 这体现了人们对“本科身份”的认知和情怀 。
那么 ， 表面看起来乙的身上被打上“学习能力和专业前途不如甲”的烙印 ， 掩盖了乙通过考研进入清华的光环 。对此 ， 我认为要辩证的看、发展的看 。
首先 ， 要知道考研很不容易 ， 尤其是考入清华这类国内顶尖大学 。乙通过不懈努力 ， 如愿以偿考入清华读研 ， 已经足以证明他的学习能力很强 ， 是自身实力的真实体现 ， 我认为这已经很成功了 ， 大可不必纠结于是否比甲弱 。
其次 ， 我们纠结于“本科身份” ， 特别是“清北情结” ， 一是虚荣心在作怪 ， 二是被一些就业的指向性所诱导 。我们必须清楚地知道：高校的牌子固然重要 ， 金牌加身 ， 或许会被人高看一眼 。但抛开家庭背景、经济条件、人脉关系甚至出国深造、转行创业等复杂因素 ， 最终决定我们学业延伸和工作发展的是学科、是专业、是研究领域 。
那么 ， 这里不再讨论甲有多么优秀、未来发展怎样 ， 单就乙的发展再多说几句：乙已经通过考研或者准备通过考研进入清华 ， 决心既下 ， 就不要再纠结自己本科不是清华这件事了 ， 那都是别人的看法 ， 与你何干？把纠结留给别人去吧 。而且 ， 高考已成过去 ， 它只是你人生的一小段 。把现在的本科读好 ， 把将来清华的研究生阶段过好 ， 此方为正道 。要向前看 ， 把后边的人生牢牢把握在自己手里 。
归纳一下：高考进入清华 ， 本科不在清华而通过考研进入清华 ， 二者肯定有区别 ， 且不少人认为高考进清华的学生相对更强 ， 但我不敢苟同 ， 我认为这种区别未必能说明什么问题 ， 也未必能决定什么结果 。个人看法 ， 仅供参考 。
考研进清华和高考进清华 ， 我猜题主的意思应该就是非清华本科考入清华研究生 ， 和清华的本科在本校读研究生 ， 二者毕业之后有什么区别 。
我只能说 ， 区别有多大不太好量化 ， 但可以类比 ， 就如同专升本和普通本科的区别 。虽然一般专升本要学5年 ， 但就作为毕业时的能力来说 ， 还是比普通本科要弱一些的 。
为什么呢？就是基础弱 。整体而言 ， 高考的成绩决定了专科生的能力就是不如本科生 。加上专科的教学内容比本科要浅不少 ， 所以最终就决定了专升本的本科生的能力不如普通本科生 。

• 如何理解“职场核心竞争力”，都包括哪些能力？
• 老少皆宜 专家教你自制夏日“清凉茶”
• 这4个“反人类”的家居设计，很多人不以为然，还在继续踩雷！
• 这些曾经非常“流行”的家装设计，正在慢慢地淡出我们的视野
• 马桶出水量小不用找师傅看，动一下“这2地方”，出水量大又猛
• OL速效减肥 不同职业的“职业”减肥法
• 家装行业太需要这场“718”了
• 结膜炎是红眼病吗？
• “本命年”为什么要系红腰带？
• 南宁“上刀山下火海”文化，惊呆了！