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生存危機一直是腔棘魚面臨的問題 ， 在漫長的歲月里 ， 它經歷了四次生物大滅絕事件 。

3.65-3.55億年前 ， 泥盆紀大滅絕 ， 消滅了幾乎82%的海洋物種 ， 被稱為“魚類的時代”的泥盆紀度過了一段痛苦的至暗時刻 。

2.5億年前 ， 二疊紀大滅絕 ， 消滅了95%的生物物種 。

2.5-2.03億年前 ， 三疊紀晚期大滅絕 ， 76%生物滅絕 ， 主要是海洋生物 。

公元前6500萬年前白堊紀末期 ， 恐龍滅絕 。 75%-80%物種滅絕 。

很多人認為腔棘魚隨著這次生物大滅絕 ， 被封印在歷史塵埃里 ， 這種生物再也不會出現在地球上 。