祭司——玛雅祭司的地位即使没有超过阿哈乌之下的次要酋长，至少也是和次要酋长平起平坐的 。事实上，兰达主教在描述新帝国晚期的情况时说过，这两个阶级都是世袭的，也都来自贵族 。
祭司的儿子和酋长的次子经常在幼年的时候就被送到高级祭司那里接受教导，希望他们将来能成为神职人员 。
大祭司的儿子或者他最近亲的家族成员会接替他的职位 。
事实上，所有的最高职位，无论是政务的还是宗教的，都是世袭的，都由每个城邦的统治家族成员担任，或者由他们的姻亲家族成员担任 。
在古帝国和新帝国仪式中心建立的重要神庙经常会举行各种各样的活动，包括庆典、祭祀、占卜、天文观测、年代计算、象形文字、宗教教育、管理祭司们居住的神庙等，这些事情在当时可以说指引着整个城邦的方向 。每个城邦的大祭司不仅是极有能力的管理者，而且是杰出的学者、天文学家和数学家，除此之外还有他们本身的宗教职责 。他们也是国家的顾问，阿哈乌会向他们咨询一些政治问题 。作为统治家族的成员，他们对城邦的关心程度不亚于阿哈乌 。事实上，把他们比作中世纪欧洲教会中集教士、政治家、行政官和战士于一身的大王公，或许也不为过 。
祭司中的另一个阶层是占卜者，是神灵的代言人，他们的职责是将神灵的回复即神谕，转达给人民 。他们受到崇高的尊敬，以至于当他们出现在公众面前时，人们会用肩膀抬着他们 。
还有一种祭司是刽子手，被称为“纳科姆”，是终身祭司 。根据兰达主教的说法，他们并没有受到太大的尊重，工作是负责切开人牲的胸部，取出他们的心脏：
这时候，纳科姆拿着一把石刀，以高超的技巧和残忍的手段，划开人牲左边乳头下的肋骨 。然后立即把手伸进胸腔，像一只暴怒的老虎那样抓住心脏，活活地撕扯出来，放在盘子里交给祭司 。祭司立即把鲜血涂抹在神像的脸上 。
纳科姆在活人献祭中所扮演的角色让人想起了对古埃及制作木乃伊的人的厌恶 。古埃及制作木乃伊的人会将尸体打开，取出里面的内脏，然后再做防腐处理 。
四位被称为“恰克”的助手会协助纳科姆完成活人献祭仪式，他们都是被推选出来的备受尊敬的老者 。
恰克抓住那个就将被献祭的可怜人，迅速把他平躺着放在石头上，然后分别按住他的四肢，以便于从中间进行分割 。
恰克的其他职责是在青春期仪式上提供协助，在玛雅新年伊始的珀普月点燃新的火焰，在制造新神像的摩尔月斋戒期间用耳朵上的血涂刷新神像 。四位恰克还会在泽科月为祈祷蜂蜜丰产的仪式提供协助 。
阿金过去是玛雅“祭司”的总称，现在也是如此，甚至被对应为天主教的“神父” 。这个词在玛雅语中的字面意思是“太阳之子”，是指13个玛雅时代或13个计数卡顿的先知 。“这些时代有13个，每一个时代都有自己单独的偶像和一个单独预测事情的祭司 。”在科苏梅尔岛的一个神殿里，阿金是负责传达神谕的人；在奇琴伊察的祭祀坑里，阿金也担任类似的职责 。在活人献祭仪式中，阿金会从纳科姆手中接过人牲的心脏，再献给玛雅神像 。
祭司是一个非常有影响力的阶层，他们可能是国家最强大的群体，甚至比贵族还要强大 。他们对天体（太阳、月亮、金星，可能还有火星）运动的了解，对月食和日食的预测能力，对普通人生活每一个阶段的渗透，使人们对他们既尊敬又害怕 。在人们对祭司彻底的迷信这一点上，其他任何阶层都无法比拟 。据我们所知，玛雅贵族和祭司之间没有出现像古埃及第20和21王朝期间发生的那种斗争，这可能是因为在古玛雅人中，贵族和祭司群体的最高成员间可能存在比较紧密的联系 。

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