面对以上溶洞特点及困难 ， 中铁二院设计人员进行了路基填筑、桥梁跨越、大坝基础隧道结构及线路改线等多种方案研究 ， 期间进行了多次专家会议及数十次方案讨论会 ， 最终确定了采用“暗河改道+溶洞回填+桥梁跨越”的总体设计方案 。

历经三年时间 ， 中铁二院设计人员在确保施工、结构及运营安全的条件下 ， 又在充分吸收了建设单位、工务管理部门意见的基础上 ， 根据现场施工进度 ， 分阶段保质保量及时完成变更设计方案 ， 保证现场施工的正常进行 。

中铁二院在处理玉京山溶洞时 ， 创新性地采用了“三个首次”：首次在高铁隧道溶洞顶板采用低预应力全粘结性锚索结构 ， 相当于在溶洞顶板设置了长锚杆加固 ， 使溶洞顶板更加稳定；首次在隧道溶洞堆积体和松渣回填体地层之中修建大断面衬砌结构 ， 即在松散渣体内修建了一个约8层楼高的大断面隧道结构 ， 创造了在复杂地质条件下隧道修建历史；首次对高铁隧道结构采用差异沉降控制进行检算 ， 并首次对隧道处理采用在运营期间进行补偿注浆控制总沉降量和差异沉降量的措施 ， 确保了隧道在运营期间的安全 。