1946年2月 ， 石磊秘密潜入长春 ， 与党的地下工作人员接头 ， 主要任务是开展对国民党长春市市长赵君迈的统战工作 ， 以及《长春新报》的复刊 ， 争取苏军同意在市里设立八路军办事处等 。 这些工作取得显著成功后 ， 当年4月初 ， 按照东北局指示 ， 石磊等人由苏军护送撤出长春 。

石磊第三次进入长春 ， 是长春第一次解放后 。 1946年4月18日 ， 我军首次攻克长春后 ， 石磊仍主持市委工作 ， 领导全市的接收、恢复生产、支援四平前线 ， 在他的领导下 ， 《长春新报》第二次复刊 ， 他还筹备召开人民代表大会等 ， 各项工作刚刚开展起来 ， 就被迫于5月23日撤出长春 。

据《中国共产党长春历史》记载 ， 1946年7月 ， 石磊任吉林省委员、宣传部长兼城工部长 。 1947年2月 ， 任中共敦化中心县委书记 。 1948年3月 ， 任中共吉林市委书记 ， 在接管吉林过程中积累了党接管城市的经验 。 他第四次进入长春时 ， 长春还未完全解放 ， 石磊率干部随作战部队进入长春市区 ， 担任市委书记、军管会副主任、卫戍司令部政委等职 ， 领导全市救灾和实行军事管制 。 他这次在长春的工作时间不长 ， 只有10天 。 1948年10月末 ， 石磊奉命离开长春 。