在整理古代典籍的同时，孔子也扩大了自己的私人学校，因为他声名远播，许多年轻人纷纷从远方来求学，接受孔子传授的学业，很多被孔子欣赏的学生就是这个时期来求学的 。
鲁国从政
公元前502年，鲁国的大臣阳虎、公山不狃（niǔ）发动了叛乱 。公山不狃占据了费（bì）邑，召请孔子去做官 。孔子一直想从政为官，让自己的理想可以付诸实行，但一直没有机会，因此他对公山不狃的召请动了心，打算前往 。孔子的学生子路非常不高兴，和孔子争辩了一番，竭力阻止他前往，孔子最终没有去 。
叛乱平息后，鲁国的内政开始好转，国君鲁定公任命孔子为中都宰，就是中都这个地方的行政长官 。孔子治理了一段时间后，中都一片欣欣向荣，其他国家的官员都来向他学习 。
鲁定公听说了之后，召见孔子问他：“学习您的施政方法来治理鲁国，您看怎么样？”孔子回答说：“即使是天下也足以治理好，岂只是治理好鲁国呢！”
这样实施了两年，鲁定公见孔子确实有本事，便升了他的官，任命他为司空，就是管理水利、工程和手工业的官员 。孔子根据土地的性质，把它们分为山林、川泽、丘陵、高地、沼泽五类，将各种作物都种植在适宜的环境里，使他们都得到了很好的生长 。
不久之后，鲁定公又升孔子做了大司寇，就是管理全国司法和刑狱的官员，相当于现在的最高法院院长 。
孔子注重以道德教化百姓，而不是以刑罚镇压百姓 。有一次，一个儿子因为不孝顺父亲，被父亲告到了孔子那里，孔子没有审判，把他们关押在了同一个牢房里，过了三个月也不判决，后来父亲请求撤回诉讼，孔子就把他们都放了 。
季孙氏听到这件事后很不高兴，他说：“司寇欺骗我，从前他曾对我说过：‘治理国家一定要以提倡孝道为先 。’现在我要杀掉一个不孝的人来教导百姓遵守孝道，为什么不可以呢？司寇却放了他，这是为什么呢？”
孔子的学生冉有把季孙氏的话告诉了孔子，孔子叹息说，军队打了败仗，不能用杀士兵来解决问题；犯罪不断发生，不能只用刑罚来制止 。这是因为统治者的教化没有起到作用，罪责不在百姓 。统治者要先对百姓进行道德教育，让他们明白敬服，如果还不行，就请贤良的人为榜样引导鼓励百姓，如果还不行，才可以使用刑罚震慑百姓 。而现在国家不对百姓施行教育，却制定了繁多的严刑峻法，官吏用刑罚约束控制百姓，所以刑罚越多犯罪越多，现在的社会风气已经败坏很久了，即使有严苛的刑法，百姓能不违犯吗？
孔子担任大司寇期间，虽然设立了法律，但由于他注重教化百姓，国家秩序良好，没有什么犯法的人，所以刑罚也没派上用场 。
孔子五十二岁时，鲁国与齐国和好，当年夏天两国约定在齐国的夹谷盟会，鲁定公任命孔子为盟会司仪 。在盟会上，齐景公受他臣下的挑唆，故意让随行的艺人表演一些羞辱鲁国的节目，孔子义正言辞地指出了齐景公的不是，下令腰斩了表演的艺人 。齐景公非常羞愧，回去后斥责了那些大臣，为了表达自己的歉意，齐景公归还了一些以前侵占的鲁国土地 。
孔子圣绩图之齐鲁会夹谷图
当时鲁国的大权被季孙氏、孟孙氏和叔孙氏三家把持，国君的权力很有限 。三家为了保护自己的利益，在各自的封地分别建了高大的都城，囤积了很多的粮食、武器和士兵 。孔子对国君鲁定公建议拆毁三家的都城，削减他们的势力，鲁定公同意了，任命孔子去执行 。孔子的学生子路是三家中势力最大的季孙氏的管家，孔子让他去说服了三家同意拆毁都城 。

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