(1)病害：主要是白粉病、炭疽病和白绢病 。白粉病为害叶片，初期叶背形成圆形黄褐色小斑点，逐渐成为大斑，叶面长出白色粉末 。严重时整叶变褐干枯；炭疽病发病初期叶片产生油渍状小点 ， 后逐渐扩大成病斑，中间灰白色 ， 边缘紫褐色，后期病斑中间穿孔，叶柄上也产生紫褐色病斑；白绢病先侵染根茎处，叶片叶脉呈紫褐色 ， 枯叶上有白色绢丝状和油菜籽大小的菌核，发病后期，霉层中形成黑色小点 。
防治方法：通风透光，降低湿度；发现白绢病株，立即拔除，并用石灰粉消毒病穴；发病初期摘除白粉病叶 ， 可选用可杀得、多菌灵、退菌特等喷雾防治，每隔7～10天喷1次，连续喷2～3次 。
(2)虫害：主要是蛞蝓，咬食黄连嫩叶，严重时全部被吃光 ， 且不再发新叶 。防治方法：用新鲜蔬菜拌敌百虫做成毒饵诱杀；也可撒石灰粉防治 。
【采收与加工】
1.采收：栽后第五年10～11月收获 。挖起全株，敲落根部泥土，齐根基部剪去须根，齐芽剪去叶片，运回加工 。
2.加工：将鲜黄连用炕烘干，边烘边翻，火力不宜过大，当炕至黄连一折就断时，趁热放入槽笼内来回撞击 ， 撞去附着的泥沙须根及叶柄 ， 即成千黄连 。以条粗壮、质坚硬、断面色红黄者为佳 。每667平方米产干黄连80～200千克 。

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